生徒会は中学、高校に分かれており、それぞれ独自の行事を企画・運営しています。中学生徒会は春のハイキングの企画運営や、オーガニクスの授業で採れた小麦、やサツマイモを使って、収穫祭などを企画します。高校生徒会はクラスマッチや学園祭の企画運営を行います。卒業前の予餞会も高校生徒会が中心となって行われます。より良い学校生活を送るために、生徒の代表として、積極的に活動を行っています。